253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2563 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  100 
 
 		 265 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  37.25 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  37.25 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  42.92 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  33.6 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2848  HAD family hydrolase  37.28 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.098244 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  36.18 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.39 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.91 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.79 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40.18 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.29 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1629  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.73 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.792065  normal  0.106855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0756  HAD family hydrolase  30.45 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  0.585902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  39.55 
 
 		 203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  33.99 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  38.74 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11249  hypothetical protein  33.59 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.612516  hitchhiker  0.00590142 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2071  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.85 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000579427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.23 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.11 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.28 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1570  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.68 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  27.82 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  28 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  28.32 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  27.02 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01170  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.9 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  27.75 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  27.95 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.25 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1643  HAD family hydrolase  27.8 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  hitchhiker  0.00147879 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.37 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.68 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.09 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  32.31 
 
 		 343 aa  97.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.76 
 
 		 359 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  25.51 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  26.43 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  32.44 
 
 		 269 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.44 
 
 		 342 aa  92.8  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  27.11 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  25.98 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  26.2 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  26.2 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  29.63 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3889  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2016  HAD-superfamily hydrolase  29.55 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0636976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6302  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIA  27.48 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2424  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.2 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.6 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0233  HAD family hydrolase  25.78 
 
 		 279 aa  89.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  24.5 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1338  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.21 
 
 		 338 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.66 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.45 
 
 		 336 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 340 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1907  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.11 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1655  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.6 
 
 		 337 aa  85.9  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0557426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  24.8 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3643  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.61 
 
 		 261 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>