226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1570 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1570  HAD family hydrolase  100 
 
 
271 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1858  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.07 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.85 
 
 
276 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
268 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  32.7 
 
 
258 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  32.44 
 
 
263 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.42 
 
 
266 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2424  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.55 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.22995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  31.03 
 
 
250 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  31.03 
 
 
250 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  32.3 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.72 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  30.27 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.44 
 
 
257 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.77 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  31.01 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.35 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.32 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2581  UMP phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
257 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.47 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.35 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  30.74 
 
 
269 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1594  UMP phosphatase  27.2 
 
 
248 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000808476  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0544  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.98 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.95 
 
 
260 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2762  UMP phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  29.12 
 
 
250 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  29.12 
 
 
250 aa  109  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3643  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.06 
 
 
261 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6302  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIA  30.53 
 
 
261 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.86 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3889  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  25.67 
 
 
254 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  25.67 
 
 
254 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.65 
 
 
259 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  27.2 
 
 
248 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
271 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  25.67 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.67 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  25.67 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.67 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1771  UMP phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2551  UMP phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000346964  unclonable  0.00000000000937616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  27.2 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  27.2 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  29.84 
 
 
248 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1733  UMP phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000210359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.67 
 
 
254 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1728  UMP phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000338596  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2099  UMP phosphatase  27.2 
 
 
248 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204469  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1511  UMP phosphatase  27.2 
 
 
252 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000195754  normal  0.444742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  30.5 
 
 
265 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.67 
 
 
254 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1840  UMP phosphatase  26.44 
 
 
248 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.272737  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1840  UMP phosphatase  27.97 
 
 
248 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000453857  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.89 
 
 
261 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1605  UMP phosphatase  26.82 
 
 
248 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000109056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  25.29 
 
 
254 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  31.32 
 
 
257 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  31.32 
 
 
257 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.92 
 
 
267 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
259 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.68 
 
 
263 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  25.29 
 
 
254 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0515  HAD superfamily hydrolase  25.62 
 
 
259 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
259 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
257 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.21 
 
 
257 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.48 
 
 
265 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.32 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2746  UMP phosphatase  25.67 
 
 
248 aa  99  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000506878  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0513  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  26.79 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0089  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.46 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3557  HAD family hydrolase  24.52 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.73 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0512  HAD family hydrolase  31.42 
 
 
256 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.425077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  27.41 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  31.2 
 
 
343 aa  96.3  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  29.43 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0039  HAD family sugar phosphatase  22.67 
 
 
258 aa  95.1  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4736  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.73 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>