283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1666 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  100 
 
 		 259 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  51.59 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  54.09 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  51.09 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  47.86 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  45.06 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  45.99 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  44.84 
 
 		 255 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  40.64 
 
 		 255 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  46.98 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  48.23 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  39.06 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  41.13 
 
 		 257 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2848  HAD family hydrolase  40.35 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.098244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  41.85 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  37.99 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  37.99 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  38.63 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2071  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.02 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000579427  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01170  conserved hypothetical protein  35.17 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  38.74 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  39.91 
 
 		 203 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.62 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  33.06 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0756  HAD family hydrolase  33.76 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  0.585902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11249  hypothetical protein  35.04 
 
 		 276 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.612516  hitchhiker  0.00590142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1629  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.84 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.792065  normal  0.106855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  32.64 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.76 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  30.27 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2424  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.57 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.51 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  34.48 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.41 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.13 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  30.86 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 257 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0089  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.64 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  34.02 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.05 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  28.44 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.89 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.35 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.56 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3643  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.72 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.63 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 276 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.13 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.93 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.98 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.79 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  31.01 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  27.02 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  30 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.79 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041725 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0572  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.11 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  27.56 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0515  HAD superfamily hydrolase  25.22 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.53 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  30.64 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  31.14 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.24 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  28 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.94 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  23.74 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1570  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1361  conserved hypothetical protein, HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.83 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0513  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0270  HAD family hydrolase  22.59 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.457254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4736  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.6 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1643  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  hitchhiker  0.00147879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>