104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0384 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  47.34 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  41.87 
 
 		 363 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  44.61 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.55 
 
 		 215 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  41.03 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.41 
 
 		 210 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  37.93 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  27.32 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.41 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.99 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  23.76 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  24.89 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.74 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.41 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.89 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  28.81 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  23.88 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  25.41 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  24.6 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  24.62 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.23 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  28.16 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  21.08 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  22.34 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  25 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.82 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.82 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  24.47 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.24 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  26.53 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  22.87 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  20.63 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.52 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  24.71 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  24.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  23.76 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  27.75 
 
 		 322 aa  45.1  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  21.39 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.38 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.04 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  25 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  28.98 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  24.23 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  22.99 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  24.29 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.04 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.71 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  25.97 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  25.97 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  29.05 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  23.53 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  33.78 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.26 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3605  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  19.73 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.12 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.24 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  25 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.39 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.06 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.62 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  22.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  24.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.79 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  30 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 252 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>