297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1902 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  100 
 
 
176 aa  357  5e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  61.68 
 
 
182 aa  209  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  57.93 
 
 
171 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  33.83 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  33.33 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  32.58 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.27 
 
 
230 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.9 
 
 
230 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  35.85 
 
 
248 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.56 
 
 
225 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
228 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  32.08 
 
 
229 aa  59.3  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 
231 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 
231 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 
232 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  29.37 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  27.56 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 
231 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.79 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
238 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.8 
 
 
234 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 
239 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.6 
 
 
227 aa  54.7  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  29.13 
 
 
234 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  29.1 
 
 
230 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.32 
 
 
254 aa  54.7  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.36 
 
 
234 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.14 
 
 
255 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  26.56 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  27.34 
 
 
224 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  37.04 
 
 
264 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  26.75 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.67 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  42.11 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.62 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
227 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  24.74 
 
 
225 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.79 
 
 
234 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.42 
 
 
239 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.42 
 
 
239 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  27.96 
 
 
239 aa  51.2  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.31 
 
 
230 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  31.58 
 
 
240 aa  51.2  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
237 aa  51.2  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  30.84 
 
 
224 aa  50.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.09 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
229 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.09 
 
 
248 aa  50.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  40 
 
 
259 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.51 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  22.33 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  29.9 
 
 
242 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  30.3 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.51 
 
 
231 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.51 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  25.38 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  29.71 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  30.69 
 
 
231 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  33.65 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  27.41 
 
 
238 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  27.41 
 
 
238 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  27.41 
 
 
238 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  27.41 
 
 
238 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
231 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0725  HAD superfamily hydrolase-like  38.67 
 
 
862 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237174  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  27.74 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  30.47 
 
 
225 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 
268 aa  48.5  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  24.41 
 
 
225 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  27.69 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.83 
 
 
233 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  24.59 
 
 
231 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.99 
 
 
241 aa  48.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  20.8 
 
 
230 aa  47.8  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
220 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  27.48 
 
 
232 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.05 
 
 
228 aa  47.8  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 
231 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 
231 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.3 
 
 
225 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  34.23 
 
 
230 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.15 
 
 
231 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  23.3 
 
 
231 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  29.52 
 
 
228 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 
236 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  29.52 
 
 
228 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  29.52 
 
 
228 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 
236 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  28.3 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0371  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
242 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
230 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  31.63 
 
 
239 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>