143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06851 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  328  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000876  probable hydrolase  77.92 
 
 		 155 aa  263  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  57.24 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1615  HAD superfamily hydrolase-like  54.48 
 
 		 188 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1902  HAD family hydrolase  33.83 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3065  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.643413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2471  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0045824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  35.96 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  30.71 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  32.28 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  30.71 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  33.07 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  33.07 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  35.96 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  29.03 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  35.56 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.02 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 234 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  31.03 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  37.8 
 
 		 256 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  30.56 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  29.52 
 
 		 245 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 248 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  27.13 
 
 		 230 aa  51.2  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.42 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.72 
 
 		 259 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.19 
 
 		 219 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  34.72 
 
 		 258 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  25.2 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.39 
 
 		 263 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.91 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.35 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  26.05 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  26.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  28.09 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  30.47 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 220 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.04 
 
 		 239 aa  47.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  29.37 
 
 		 232 aa  47.4  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  21.7 
 
 		 241 aa  47.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  29.73 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  25.3 
 
 		 235 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.32 
 
 		 244 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  26.43 
 
 		 242 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.58 
 
 		 230 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 255 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.05 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  29.79 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.79 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.17 
 
 		 245 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.79 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.79 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.79 
 
 		 225 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  32.86 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  25 
 
 		 256 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  29.92 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  29.05 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  30.23 
 
 		 227 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.33 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.33 
 
 		 230 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  29.05 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  25 
 
 		 231 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  29.33 
 
 		 245 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  27.78 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  26.24 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  26.24 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.52 
 
 		 228 aa  44.3  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.89 
 
 		 230 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  29.67 
 
 		 225 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  31 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.56 
 
 		 224 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.3 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.89 
 
 		 255 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  28.67 
 
 		 245 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  26.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  26.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  26.45 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  28.38 
 
 		 238 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  29.33 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.4 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  26.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  26.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  26.24 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  27.46 
 
 		 225 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  28.7 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  22.43 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 246 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  29.05 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>