78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0589 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  64.63 
 
 		 230 aa  298  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  62.45 
 
 		 233 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  62.01 
 
 		 233 aa  287  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  55.31 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.75 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  38.12 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  37.73 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  32 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  38.61 
 
 		 238 aa  121  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  38.61 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  35.27 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.32 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.38 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.89 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  36.49 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.78 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.98 
 
 		 268 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.83 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.83 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  30.48 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  33.33 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  34.22 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  34.22 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.3 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.98 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  30.52 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.29 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.61 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  31.48 
 
 		 158 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06851  hypothetical protein  30.56 
 
 		 156 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.77 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  34.69 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.01 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.76 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  25.53 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.94 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  27.61 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  26.61 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  25.62 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.17 
 
 		 221 aa  45.1  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  25 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.77 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  25.59 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  25.6 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.72 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  25.6 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  33.04 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  25.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  25.6 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  25.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.6 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  25.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  25.62 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  24.68 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  26.36 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  25.12 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  25.93 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  23.26 
 
 		 231 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  26.02 
 
 		 228 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  28.79 
 
 		 226 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1387  hydrolase  27.92 
 
 		 266 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.668833  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  29.01 
 
 		 245 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.1 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  29.01 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>