35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04239 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  66.1 
 
 		 250 aa  325  5e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  44.92 
 
 		 256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  46.15 
 
 		 233 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.59 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  43.3 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.75 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  44.83 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  45.59 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  44.83 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.86 
 
 		 234 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.32 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.27 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  45.1 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.92 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.39 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  40.37 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  45.81 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.86 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.13 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  42.16 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.53 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  38.12 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.8 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  32.55 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  32.84 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  30.54 
 
 		 230 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  30.95 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  30.52 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.26 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  27.2 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.28 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  25.23 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  22.79 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>