53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2535 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  64.41 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  63.98 
 
 		 237 aa  304  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  63.98 
 
 		 237 aa  304  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  59.32 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.51 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  54.94 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.08 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  53.88 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  55.98 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  50.43 
 
 		 231 aa  231  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  45.37 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  43.04 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  46.09 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  43.48 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.72 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  42.86 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.98 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  38.33 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.72 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.44 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.39 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  38.25 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.53 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  35.45 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  32.88 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  34.51 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  34.5 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  31.3 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.67 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.07 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  26.09 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  25.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  25.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  25.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  25.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  25.26 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  24.74 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  22.44 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  23.77 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.27 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  22.94 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  22.94 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  22.51 
 
 		 225 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  22.51 
 
 		 225 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  22.51 
 
 		 225 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  24.5 
 
 		 225 aa  42  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  22.51 
 
 		 225 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.51 
 
 		 225 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  22.51 
 
 		 225 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  26.06 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>