62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3886 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  65.65 
 
 
234 aa  301  8.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  58.97 
 
 
237 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  58.97 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  58.97 
 
 
237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60.62 
 
 
234 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  58.19 
 
 
233 aa  278  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  59.29 
 
 
234 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  57.39 
 
 
238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  55.98 
 
 
237 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  56.56 
 
 
231 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  47.3 
 
 
238 aa  214  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  50.5 
 
 
256 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  45.45 
 
 
245 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  46.9 
 
 
234 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  45.29 
 
 
229 aa  195  5.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  40.27 
 
 
249 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.59 
 
 
232 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.45 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.83 
 
 
250 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.09 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  41.31 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.65 
 
 
268 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  37.84 
 
 
243 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.85 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  35.43 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  40.1 
 
 
233 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  39.11 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  37.38 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.93 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.57 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  24.15 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.31 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  25.12 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  24.75 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.36 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  22.12 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  26.25 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  27.62 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  25 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  25 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  25 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.32 
 
 
219 aa  45.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28.43 
 
 
235 aa  45.1  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.34 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  25.56 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  27.94 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.23 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.84 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  28.16 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  24.64 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
251 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  22.58 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  23.61 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 
217 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  26.15 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.27 
 
 
229 aa  42  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  28.14 
 
 
220 aa  42  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  23.74 
 
 
230 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>