75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2976 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  89.7 
 
 		 233 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1570  hydrolase  69.13 
 
 		 230 aa  322  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  62.01 
 
 		 231 aa  287  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21850  predicted HAD superfamily hydrolase  53.98 
 
 		 243 aa  249  4e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370174  normal  0.0721365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3328  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.59 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1418  hydrolase  42.29 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5807  hypothetical protein  42.42 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0504  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.91 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0361891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0459  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.4 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.940296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0795  hydrolase  32.89 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3886  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.11 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.704486  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2216  hydrolase  34.39 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.211276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5435  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.35 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1033  hydrolase  39.29 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4295  hydrolase  38.12 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4024  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.02 
 
 		 238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0543  hydrolase  36.59 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1727  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0670  haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.8 
 
 		 234 aa  115  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2305  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.96 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2342  hydrolase  36.1 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338677  normal  0.171089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0687  HAD superfamily hydrolase  36.1 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3606  hydrolase  35.07 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.770692  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0862  hydrolase  33.33 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04239  HAD superfamily hydrolase  32.84 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2535  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.5 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1000  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.84 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.698298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0347  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.81 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.39 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2811  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.54 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.58 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  29.11 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.67 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  32.65 
 
 		 225 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 231 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.77 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.23 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.729553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.77 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  27.88 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  28.46 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  26.17 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  22.61 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  22.77 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  26.89 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  26.89 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.05 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  25.22 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.15 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  31.39 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  24.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.47 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  35.05 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  31 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  23.36 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  23.66 
 
 		 247 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.36 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 220 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.75 
 
 		 217 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.22 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>