54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0288 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  37.91 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  35.51 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.3 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.76 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.84 
 
 		 213 aa  121  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.73 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  26.94 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.64 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  22.84 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  25.91 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12851  phosphatase  23.04 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  normal  0.0690398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.04 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  25.49 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.71 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2976  hydrolase  28.93 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25280  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  23.92 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0213796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.21 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.93 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  26.57 
 
 		 454 aa  43.5  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  23.92 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.39 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  41.27 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3200  hydrolase  29.75 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0777437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  25 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  22.16 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  25.49 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 		 242 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.12 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  24.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.87 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  24.75 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  27 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  22.46 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.67 
 
 		 220 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  28.88 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  24.48 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>