47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1530 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  26.94 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.79 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.91 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.13 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  24.77 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  28.65 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.13 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.8 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  24.14 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  24.14 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12851  phosphatase  24.46 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  normal  0.0690398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  26.04 
 
 		 223 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.74 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  23.39 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  28.43 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  25.26 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  22.6 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  26.18 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.87 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1937  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  23.23 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.37 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  26.49 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.36 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2014  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2259  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.24 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.70035e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2015  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000565741  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2215  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.24 
 
 		 228 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  23.48 
 
 		 225 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.01 
 
 		 224 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  24.02 
 
 		 225 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  27.84 
 
 		 249 aa  41.6  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  24.08 
 
 		 221 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.29 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.24 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  25.97 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>