89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0786 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 
210 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  68.75 
 
 
210 aa  302  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  46.89 
 
 
224 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.26 
 
 
224 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  46.63 
 
 
211 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  43.27 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  42.86 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  43.75 
 
 
215 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.38 
 
 
224 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.71 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  30.69 
 
 
220 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.84 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.26 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  27.04 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  27.31 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.85 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  25.13 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  24.17 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  26.42 
 
 
233 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
237 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  24.87 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.32 
 
 
330 aa  50.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.54 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  24.87 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.56 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.74 
 
 
208 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  25 
 
 
223 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  25 
 
 
228 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  26.21 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.2 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  22.03 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.59 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  26.21 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  23.27 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  23.81 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  24.06 
 
 
272 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  25.58 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  25.39 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.84 
 
 
217 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  23.58 
 
 
272 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.38 
 
 
218 aa  45.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  27.64 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  22 
 
 
217 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  22.75 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.08 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.44 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.94 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  25.14 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1246  HAD superfamily hydrolase  23.29 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.93 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  25.51 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.63 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  24.44 
 
 
222 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  20.59 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  22.47 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  21.67 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.7 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  23.63 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  22.35 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  23.74 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.7 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  22.86 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  18.78 
 
 
221 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  22.86 
 
 
215 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  20.77 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  23.95 
 
 
233 aa  42.4  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  23.23 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  24 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  27.72 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  20.34 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
215 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  23.2 
 
 
230 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  23.56 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  22.22 
 
 
233 aa  42  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  28.35 
 
 
226 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  21.91 
 
 
234 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  23.08 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.39 
 
 
216 aa  41.6  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  25.86 
 
 
223 aa  41.6  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  27.5 
 
 
225 aa  41.2  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>