94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1711 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  46.63 
 
 
210 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  42.86 
 
 
210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  40 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  39.42 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  39.81 
 
 
215 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.81 
 
 
224 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.76 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.63 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  33.51 
 
 
220 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.68 
 
 
217 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 
224 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3578  hypothetical protein  30.85 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.22 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  27.72 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  23.15 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.44 
 
 
330 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  23.83 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5521  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.743773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3605  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4762  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.86 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.17 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  31.25 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.15 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  25.68 
 
 
272 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  36.64 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  36.64 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.65 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.5 
 
 
218 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  36.64 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  36.64 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  22.34 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  25.35 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  23.92 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 
226 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  36.64 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
272 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  26.7 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.53 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.84 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  24.65 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 
234 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  26.37 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  25.88 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  22.77 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  22.77 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  23.96 
 
 
238 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  25.73 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  26.6 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  22.77 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  27.5 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  23.15 
 
 
456 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.6 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  25.52 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.62 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  23.15 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  24.61 
 
 
266 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 
229 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  23.47 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  23.76 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  23.9 
 
 
456 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  27.05 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  23.66 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 
223 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.5 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  23.78 
 
 
228 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1575  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
238 aa  42  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000310395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 
221 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  25.29 
 
 
232 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.65 
 
 
218 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  24.61 
 
 
272 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.18 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>