142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3690 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.66 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  52.38 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.1 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.41 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  33.52 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.04 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.61 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  32.02 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  34.8 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  32.58 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  23.56 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  28.21 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.88 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.46 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  32.8 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  29.41 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.84 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.16 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.72 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.09 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  26.98 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.65 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.35 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  30.65 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  34.65 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  34.65 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  24.47 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  29.47 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.38 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  29.9 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  28.78 
 
 		 454 aa  48.5  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  28.26 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.82 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  27.88 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  34.65 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  29.06 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0306  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IB (PSPase-like)  27.14 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1883  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.27 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00501827  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  26.06 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25280  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.91 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0213796  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25.4 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  25.39 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  22.64 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  25.67 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.89 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.66 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.18 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0983  P-Ser-HPr phosphatase  27.98 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.94 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 		 227 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.32 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.5 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  32.74 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  28.71 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.4 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  26.79 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.56 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.18 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.69 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.32 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  23.44 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  26.22 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.46 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  27.86 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>