35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2667 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 223 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  32.84 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  32.61 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.32 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  32.98 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.43 
 
 		 213 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.72 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.57 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.73 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  27.96 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12851  phosphatase  24.02 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  normal  0.0690398 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  27.33 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  26.09 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  24.18 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  25.94 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  25.67 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  31.52 
 
 		 758 aa  45.1  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  26.8 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.48 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  29.71 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  31.82 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  31.82 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  23.24 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  23.24 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  23.24 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.18 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  20.2 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.54 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  29.47 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 218 aa  42  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  29.47 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>