99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2645 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2645  hydrolase  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  76.78 
 
 		 213 aa  345  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2045  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.35 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3690  HAD superfamily hydrolase  52.38 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0426  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.89 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  35.51 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1599  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.97 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0287607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1591  HAD family hydrolase  32.24 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1789  HAD superfamily hydrolase  34.44 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0761  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.89 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2667  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.98 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  27.04 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  28.23 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14011  hypothetical protein  24.23 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1530  hydrolase  24.77 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.04 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.27 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  29.02 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.65 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1871  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.56 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  29.17 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.91 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3082  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  25.11 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  25.89 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.34 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  26.04 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3340  HAD family hydrolase  22.8 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000100356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  25.82 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  25.51 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  24 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  23.24 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.9 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  24.37 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  26.78 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.69 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  24.43 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.08 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1839  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.605398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  24.21 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  24.61 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  23.61 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0704  HAD superfamily hydrolase  31.3 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  25 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  22.58 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  24.08 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  24.1 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  21.74 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.1 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  24.56 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  24.73 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12851  phosphatase  21.63 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.35108  normal  0.0690398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  24.81 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  23.26 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  26.11 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  24.76 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.81 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  22.4 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  25.62 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  26.46 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  24.18 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25280  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  23.76 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0213796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1944  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.74 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2348  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.6 
 
 		 342 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000426871  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.99 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0794  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.76 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0913327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0589  hydrolase  25.62 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.350503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  24.14 
 
 		 256 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  26.76 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  25.14 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  21.57 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  21.24 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.04 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  23.91 
 
 		 194 aa  42  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  23.4 
 
 		 216 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  24.78 
 
 		 242 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  28.26 
 
 		 221 aa  42  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  26.46 
 
 		 230 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  24.66 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  27.69 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  23.92 
 
 		 238 aa  41.2  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>