More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3203 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  54.21 
 
 
218 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.73 
 
 
222 aa  201  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  48.28 
 
 
217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  48.28 
 
 
245 aa  198  5e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  48.61 
 
 
216 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40.74 
 
 
221 aa  178  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40.74 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  46.23 
 
 
215 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  44.95 
 
 
224 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  42.2 
 
 
221 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  41.71 
 
 
225 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  46.45 
 
 
224 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  45.41 
 
 
216 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  42.2 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  45.97 
 
 
237 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  43.06 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  43.06 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  43.06 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 
221 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  43.6 
 
 
221 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  43.4 
 
 
221 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  41.04 
 
 
216 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  37.85 
 
 
219 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.07 
 
 
217 aa  150  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  41.38 
 
 
219 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  38.79 
 
 
220 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.62 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.71 
 
 
220 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  35.71 
 
 
221 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.78 
 
 
221 aa  134  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.52 
 
 
229 aa  131  9e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.29 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.72 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.84 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.41 
 
 
217 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.28 
 
 
232 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.65 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  36.32 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  32.87 
 
 
211 aa  119  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
228 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.9 
 
 
223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.22 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.62 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  36.98 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  36.98 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  36.98 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  34.54 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.7 
 
 
244 aa  107  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  33.02 
 
 
231 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.5 
 
 
228 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
225 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
225 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
225 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.23 
 
 
252 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
227 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.14 
 
 
228 aa  95.1  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.31 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 
226 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 
235 aa  92  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
272 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  29.25 
 
 
239 aa  92  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  34.03 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 
228 aa  89  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
228 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 
226 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  30.23 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.36 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  25.84 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  28.43 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  29.77 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>