More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  100 
 
 
220 aa  438  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  57.87 
 
 
232 aa  244  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.87 
 
 
231 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  48.42 
 
 
228 aa  178  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  51.46 
 
 
225 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  51.46 
 
 
225 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  51.46 
 
 
225 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  47.47 
 
 
291 aa  175  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.8 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.56 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.09 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  37.61 
 
 
225 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  39.81 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  37.56 
 
 
221 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.03 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  45.41 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
221 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  39.37 
 
 
218 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.12 
 
 
221 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  38.12 
 
 
221 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  38.12 
 
 
221 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.47 
 
 
226 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 
221 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.13 
 
 
228 aa  158  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.45 
 
 
228 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.79 
 
 
222 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
216 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  41.78 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.71 
 
 
217 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  38.79 
 
 
220 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  37.44 
 
 
221 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  35 
 
 
215 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  37.05 
 
 
239 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.27 
 
 
244 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  37.44 
 
 
221 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  36.18 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.08 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.19 
 
 
223 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  35.68 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  34.88 
 
 
224 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  35.68 
 
 
237 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  35.48 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  34.63 
 
 
217 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.21 
 
 
238 aa  135  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  34.63 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  40 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.35 
 
 
217 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  40.19 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  38.53 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.07 
 
 
235 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.58 
 
 
220 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  36.64 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  32.42 
 
 
211 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.41 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  32.09 
 
 
221 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.31 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.28 
 
 
223 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.63 
 
 
227 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  27.68 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  25.69 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  30.32 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.14 
 
 
220 aa  92  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
221 aa  92  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.87 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.94 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.77 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
251 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.91 
 
 
235 aa  84.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
254 aa  84.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
242 aa  84.7  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  22.62 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.11 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.98 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  32.67 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  28.77 
 
 
218 aa  82  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  27.91 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>