More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2445 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  57.87 
 
 
220 aa  244  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.47 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.39 
 
 
229 aa  168  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.47 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  38.12 
 
 
225 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  45.26 
 
 
228 aa  151  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.24 
 
 
228 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.41 
 
 
221 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.98 
 
 
221 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  45.6 
 
 
291 aa  146  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  37.79 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  40.29 
 
 
216 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  37.79 
 
 
221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  37.79 
 
 
221 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  36.92 
 
 
221 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  37.44 
 
 
218 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 
221 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.92 
 
 
252 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  45.5 
 
 
225 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  45.5 
 
 
225 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  45.5 
 
 
225 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  36.92 
 
 
221 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  38.38 
 
 
215 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  41.03 
 
 
221 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.53 
 
 
244 aa  137  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  41.03 
 
 
221 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  44.33 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.5 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.84 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  36.49 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.41 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  38.64 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  34.26 
 
 
219 aa  129  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  35.12 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.28 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  34.58 
 
 
245 aa  128  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  40.28 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  37.76 
 
 
224 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  36.54 
 
 
216 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.87 
 
 
221 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  36.54 
 
 
237 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  36.06 
 
 
224 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  33.91 
 
 
239 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  36.28 
 
 
220 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  39.55 
 
 
219 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.87 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.81 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.22 
 
 
235 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  31.16 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  34.58 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.94 
 
 
220 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.67 
 
 
223 aa  111  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  35.07 
 
 
247 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.77 
 
 
220 aa  104  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.02 
 
 
221 aa  101  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  33.03 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.07 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  28.5 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.44 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.73 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  29.78 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  26.7 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.98 
 
 
212 aa  79  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  24.75 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.82 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.36 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  25.23 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.7 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.4 
 
 
221 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.82 
 
 
216 aa  71.2  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  30.4 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  29.87 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.84 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  28.32 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  32.9 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  29.07 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>