More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0112 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  92.41 
 
 		 224 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  94.44 
 
 		 216 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  93.52 
 
 		 237 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  80.93 
 
 		 216 aa  361  6e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  73.61 
 
 		 221 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  75.35 
 
 		 215 aa  329  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  73.15 
 
 		 221 aa  327  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.21 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  44.29 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  45.37 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  49.74 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  49.74 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  49.74 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  49.74 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  47.6 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  49.74 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  49.74 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  49.21 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  48.15 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  46.43 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  45.92 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  44.27 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  44.95 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  43.81 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.37 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.38 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  36.18 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.75 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.05 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.85 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  36.79 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.68 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.62 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  37.97 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  36.79 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  38.27 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.98 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.43 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.76 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  34.23 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  34.23 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  34.23 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.13 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.42 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  34.7 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.92 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  32.09 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.98 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  36.9 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  31.9 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.86 
 
 		 223 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.59 
 
 		 252 aa  111  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  32.02 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  30.88 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  32.54 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.52 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.31 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.75 
 
 		 216 aa  88.6  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.96 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.3 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  22.27 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  29.59 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.28 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  28.06 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.14 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.54 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.15 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.71 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  28.16 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  26.54 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  31.79 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.68 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  22.79 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  26.77 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  25.98 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  25.12 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.82 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  26.4 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>