More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1720 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  49.28 
 
 		 218 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  52.68 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  55.26 
 
 		 215 aa  207  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  55.26 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  55.26 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  54.74 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  54.21 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  53.93 
 
 		 221 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  46.73 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  53.68 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  47.26 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  47.26 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  46.34 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  45.15 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  44.44 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  44.44 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  46.12 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  45.28 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  44.88 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  44.81 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  44.81 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.47 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.9 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  41.55 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  37.26 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.58 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  38.79 
 
 		 220 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  38.83 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.59 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.81 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  42.16 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.23 
 
 		 221 aa  144  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  43.33 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  38.05 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.42 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  35.58 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.62 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  38.68 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.1 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.62 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.82 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.15 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  37.3 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.1 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.09 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.62 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  37.02 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.79 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.62 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  37.23 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  28.99 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  31.92 
 
 		 232 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.82 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  30.56 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.4 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.09 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.23 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  28.38 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.1 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  31.8 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.72 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  28.17 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 		 230 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.84 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.64 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.64 
 
 		 221 aa  85.1  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.5 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.85 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0218  HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.64 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.64 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.7 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.17 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  26.89 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.47 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>