71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2348 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2348  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 342 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000426871  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0504  phosphatase-like protein  41.74 
 
 		 324 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3438  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.32 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  25.46 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  29.82 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.36 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.46 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2711  HAD family hydrolase  27.83 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  25.83 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.48 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2839  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0722376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  27.06 
 
 		 232 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.32 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  24.89 
 
 		 219 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.85 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  27.87 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  27.35 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  26.94 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  29.72 
 
 		 247 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.75 
 
 		 222 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  23.77 
 
 		 220 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 		 219 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.56 
 
 		 263 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29407  predicted protein  28.69 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160817  normal  0.108947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2228  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.375493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  25.33 
 
 		 230 aa  47  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 		 227 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.03 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 221 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.57 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  24.51 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  23.3 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1903  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.56 
 
 		 213 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  24.3 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  25.93 
 
 		 272 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.7 
 
 		 216 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.81 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  22.87 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.83 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  25.48 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  24.46 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  24.43 
 
 		 220 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 		 218 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  24.89 
 
 		 211 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.17 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.79 
 
 		 217 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 		 224 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.32 
 
 		 238 aa  43.1  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2231  HAD superfamily hydrolase  22.13 
 
 		 213 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.77 
 
 		 235 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.43 
 
 		 239 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2343  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.13 
 
 		 211 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 224 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  34.96 
 
 		 209 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  34.96 
 
 		 209 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  19.65 
 
 		 221 aa  42.7  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2077  HAD superfamily hydrolase  22.13 
 
 		 211 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.251554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>