More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43120 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  100 
 
 		 291 aa  605  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29407  predicted protein  41.88 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.160817  normal  0.108947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 		 226 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  30.83 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.09 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  29.46 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.53 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  28.19 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.37 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  29.52 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.17 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  29.96 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  30.22 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.96 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.14 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.47 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  29.78 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 233 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  32 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.02 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  28.85 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29.8 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  26.17 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.17 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  26.17 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  31.11 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.27 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.17 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  26.5 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.63 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.44 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  23.92 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.43 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25280  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  27.41 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0213796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  27.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.98 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  29.11 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.41 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  27.49 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.89 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.47 
 
 		 206 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5014  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.41 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.96 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>