93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2888 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  60.09 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  54.95 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  45.09 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  48.13 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  43.17 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  48.37 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.2 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.44 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  40.83 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  41.59 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  42.98 
 
 		 272 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.54 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.17 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  38.64 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.5 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  34.35 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  37.73 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.38 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  34.67 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.19 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.72 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  26.99 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.68 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.41 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.09 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.09 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.34 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  25 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  32.89 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.87 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  27.56 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  25.89 
 
 		 284 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.38 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  28.5 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.55 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.67 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  27.47 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.26 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.34 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.24 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 225 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  30 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  25.57 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  30.71 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  36.14 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  26.99 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.83 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  28.8 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.42 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  31.21 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  29.82 
 
 		 472 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.96 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  25.21 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  24.37 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.76 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  27.03 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2839  HAD family hydrolase  44.07 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0722376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.11 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.62 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.03 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2348  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.85 
 
 		 342 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000426871  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  23.83 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.33 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 		 231 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  27.94 
 
 		 291 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  45.65 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>