82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4428 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  69.05 
 
 		 486 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.55 
 
 		 206 aa  193  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  45.5 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.44 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4734  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.25 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8903  phosphatase-like protein  48.96 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8096  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.33 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  43.78 
 
 		 472 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4626  hydrolase  36.32 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413109  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6159  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  37.24 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2442  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.23 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3579  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.22 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0582871  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.19 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  27.54 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  24.17 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  28.5 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.69 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.9 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.9 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.6 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.37 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  21.46 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  24.37 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.76 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  23.86 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  21.46 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.06 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.43 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  29.95 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.91 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.24 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  28.5 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  35.17 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  27.89 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.15 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  35.17 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  42.62 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  32.48 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.15 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  24.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  23.79 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  25.81 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.98 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.07 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  30.77 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  24.49 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  29.72 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  25.79 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  20.88 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04348  phosphoglycolate phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00760)  25.13 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161139  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.77 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  24.3 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  24.3 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.19 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.23 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  22.66 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  23.72 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  22.66 
 
 		 217 aa  42  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  44.44 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  23.72 
 
 		 216 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  23.72 
 
 		 216 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.56 
 
 		 229 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.44 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>