192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3579 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3579  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
241 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0582871  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43 
 
 
218 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  40.78 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  47.85 
 
 
486 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.24 
 
 
206 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4734  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.06 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  43.81 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  39.39 
 
 
472 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8903  phosphatase-like protein  41.21 
 
 
205 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6159  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  39.81 
 
 
202 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8096  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.59 
 
 
205 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2442  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.97 
 
 
201 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4626  hydrolase  35.29 
 
 
207 aa  85.1  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413109  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.27 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  35.44 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.44 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.28 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  30 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  30 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.44 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  31.02 
 
 
218 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.18 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  30.85 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.9 
 
 
217 aa  59.3  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  33.79 
 
 
221 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  36.54 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  30.52 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  36.54 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  36.54 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  32.84 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  30.52 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  29.19 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.54 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  30.58 
 
 
222 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.09 
 
 
218 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.73 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  26.73 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  28.64 
 
 
219 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  29.19 
 
 
219 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  29.03 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  26.79 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  56.6 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  29.67 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  25.25 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  34.27 
 
 
225 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  25.81 
 
 
219 aa  52  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  29.72 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  37.4 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  37.4 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  37.4 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.64 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  26.89 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.89 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.14 
 
 
217 aa  50.4  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  21.89 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.74 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.51 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  32.02 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.27 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.3 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.3 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117122  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.42 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.73 
 
 
219 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.13 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  24.24 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
218 aa  48.5  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  32.81 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  24 
 
 
214 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  25.94 
 
 
219 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  31.16 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  23.72 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.95 
 
 
456 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  29.25 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.91 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.67 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.7 
 
 
220 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  27.19 
 
 
220 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>