115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0479 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  65.02 
 
 		 228 aa  261  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4734  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.31 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  46.8 
 
 		 486 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.47 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  45.69 
 
 		 472 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8096  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.04 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.44 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8903  phosphatase-like protein  44.85 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6159  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  40.7 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4626  hydrolase  39.09 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413109  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3579  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.2 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0582871  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2442  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.34 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  36.77 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  28.23 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  28.27 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.99 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.94 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.46 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  28.92 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  29.78 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.24 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.24 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.09 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.51 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.71 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.97 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  31.45 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  24.88 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.21 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  28.21 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.23 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.21 
 
 		 296 aa  49.7  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.01 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.85 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  24.2 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 272 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.65 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  23.39 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  32.28 
 
 		 245 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  28.37 
 
 		 230 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  26.84 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  30.67 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.26 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  29.05 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.27 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.99 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  32 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  30.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  28.5 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.59 
 
 		 330 aa  45.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.47 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  28.44 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 237 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 		 235 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.23 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.31 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  27.83 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  25.51 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.21 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  23.98 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.11 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  29.15 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  28.51 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.13 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.89 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  30.37 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.89 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.65 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.36 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  30.53 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>