39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3726 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  61.95 
 
 
245 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  51.09 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  47.88 
 
 
246 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.52 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.07 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.17 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.01 
 
 
238 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  35.02 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.37 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  34.96 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  36.94 
 
 
237 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.78 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.16 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 
249 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.39 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  32.75 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  26.73 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.26 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  23.28 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  27.07 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.09 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  28.63 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.64 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  24.15 
 
 
487 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.52 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.81 
 
 
213 aa  48.9  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.86 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  22.75 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.12 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.86 
 
 
231 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.01 
 
 
233 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.75 
 
 
230 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.75 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  26.01 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  26.18 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  26.11 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  24.36 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  26.95 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>