93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0506 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 233 aa  475  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  61.3 
 
 		 233 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  64.91 
 
 		 230 aa  296  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  62.61 
 
 		 230 aa  294  6e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  61.84 
 
 		 230 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.77 
 
 		 230 aa  279  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.15 
 
 		 230 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.37 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  36.24 
 
 		 232 aa  121  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  33.18 
 
 		 234 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.91 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  31.76 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  35.86 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.78 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  31.82 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.41 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.35 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  31.38 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  31.88 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  30.62 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.92 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.92 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.48 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.21 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.27 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.43 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  30.09 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  30.09 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  30.14 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  29.3 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  25.45 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.53 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.87 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  28.44 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.37 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  29.22 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.57 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.05 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  27.07 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.24 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  22.64 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0481  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.158536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  28.37 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  25.6 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  23.71 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.28 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  26.34 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2797  hydrolase  22.41 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  25.42 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4383  putative phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335869  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  24.34 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  24.54 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  26.52 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  23.21 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.12 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  24.49 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  22.94 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.72 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4912  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.71 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  32.31 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.64 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  25.5 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.01 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.54 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  25.76 
 
 		 220 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  23.58 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0316  phosphoglycolate phosphatase  22.97 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  25.57 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  23.85 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  25.56 
 
 		 230 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  25.84 
 
 		 263 aa  42  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  27.21 
 
 		 219 aa  42  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  24.55 
 
 		 272 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0258  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 235 aa  42  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.691366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>