97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  100 
 
 
237 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  43.06 
 
 
229 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.95 
 
 
229 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.59 
 
 
239 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.1 
 
 
229 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.72 
 
 
224 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  40.65 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  38.89 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.06 
 
 
238 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.43 
 
 
249 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  37.16 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  41.03 
 
 
249 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  35.22 
 
 
238 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.25 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.94 
 
 
255 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  34.25 
 
 
487 aa  112  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  40.09 
 
 
234 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  37.73 
 
 
232 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.07 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.89 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  40.53 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  34.56 
 
 
230 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  37.39 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.59 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.63 
 
 
230 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.82 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.82 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  31.82 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.92 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.56 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  32.88 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  35.93 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  33.65 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  32.72 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.14 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  27.18 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.9 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  29.95 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1883  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.73 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00501827  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
229 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.91 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  28.18 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  29.96 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  25.59 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  27.91 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  31.33 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.23 
 
 
296 aa  48.5  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.04 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  29.28 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
221 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  26.46 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  28.25 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.3 
 
 
233 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  26.92 
 
 
238 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2348  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.83 
 
 
342 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000426871  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.98 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.33 
 
 
212 aa  45.1  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  30.71 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  28.89 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  28.4 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0537  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.85 
 
 
260 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  27.15 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  29.93 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.35 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0914  hypothetical protein  22.33 
 
 
216 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  23.53 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
221 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  23.47 
 
 
214 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2152  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.9 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00286727  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.67 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4417  HAD family hydrolase  26.22 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155896  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  25.74 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  26.42 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2075  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  42  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00099021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
227 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  27.93 
 
 
214 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.73 
 
 
219 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
229 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.93 
 
 
219 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
228 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.88 
 
 
618 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>