215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1120 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  80.35 
 
 
232 aa  354  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.67 
 
 
228 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  45.66 
 
 
230 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  37.13 
 
 
230 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  37.93 
 
 
233 aa  141  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  44.54 
 
 
233 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.86 
 
 
233 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.04 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.17 
 
 
230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  39.57 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  36.97 
 
 
230 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  40.37 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.34 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  36.71 
 
 
272 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.84 
 
 
233 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.73 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  41.41 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.36 
 
 
229 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33.04 
 
 
246 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.96 
 
 
224 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  33.91 
 
 
238 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.55 
 
 
229 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  37.39 
 
 
237 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.2 
 
 
249 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.1 
 
 
238 aa  99  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.61 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.58 
 
 
227 aa  88.6  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.87 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.84 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.05 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 
487 aa  82  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  35.59 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.82 
 
 
246 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  26.99 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  34.25 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.63 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  24.52 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  28.82 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.9 
 
 
296 aa  58.9  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.57 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  25.55 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.59 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.7 
 
 
221 aa  55.1  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  25.58 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  23.87 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  25 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  30.28 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.35 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.45 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  28.7 
 
 
230 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  33.59 
 
 
221 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.27 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.31 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  39.02 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  38.02 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  21.8 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  30.19 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  38.02 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  30.73 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  29.87 
 
 
237 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  26.49 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  26.87 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.24 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  26.55 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  56 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  29.17 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  23.66 
 
 
225 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  28.15 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  24.17 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.03 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.41 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.14 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  27.66 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.72 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  26.2 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.41 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  30.23 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  22.51 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.08 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  24.89 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>