150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3764 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  100 
 
 		 232 aa  463  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  80.35 
 
 		 231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.56 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  43.61 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  43.32 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  36.75 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  38.79 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.24 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.19 
 
 		 230 aa  138  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  36.32 
 
 		 230 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.92 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.63 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  38.5 
 
 		 272 aa  134  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.91 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.84 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.64 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.38 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  37.83 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.78 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.22 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  34.36 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  34.51 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  39.49 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.37 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  37.73 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.94 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.05 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.8 
 
 		 231 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.75 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.78 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.22 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  29.73 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  28.27 
 
 		 487 aa  79.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  33.91 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.75 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  31.12 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  28.7 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  30.04 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  24.89 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.23 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  29.22 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  28.08 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  32.95 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.99 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  27.6 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.29 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  25.11 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.19 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  29.07 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  30.37 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.6 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  29.02 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  62.22 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  23.74 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  26.48 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  26.48 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  27.48 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  23.96 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.47 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  21.9 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.47 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  24.39 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  28.18 
 
 		 264 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.47 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  23.04 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  29.05 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  24.2 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  24.2 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  24.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  21.82 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.44 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  25.34 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  28.64 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  30.59 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  25.44 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  24.17 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  26.58 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.71 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  23.15 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1683  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.03 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  27.49 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  26.64 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  27.65 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.65 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  21.9 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  23.08 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>