102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5846 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 229 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  47.44 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  46.75 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  44.75 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  48.67 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.08 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  41.2 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  39.29 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  41.67 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.6 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  37.99 
 
 		 238 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  38.25 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.64 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.8 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  40.52 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.39 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  39.22 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.16 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  37.55 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.07 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  35.59 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.04 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  38.96 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.91 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.08 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.63 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.2 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  29 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  27.35 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  38.08 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.21 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  30.91 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  31.11 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.43 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  32.23 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  35.59 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  31.85 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  30.73 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  29.6 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  31.15 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  29.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  28.38 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.67 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  35.16 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.14 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  28.25 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.04 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01370  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.647335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.38 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0276  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.24 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.23 
 
 		 296 aa  46.2  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3310  HAD family hydrolase  33.73 
 
 		 232 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.58 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  50 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  50 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  28.07 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0160  HAD family hydrolase  28.99 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300128  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.88 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0131  HAD family hydrolase  27.9 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.39 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  27.63 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  27.66 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  30.88 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  24.9 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  29.24 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  24.48 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  32.14 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1822  putative phosphatase  26.96 
 
 		 218 aa  42  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 224 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.17 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 227 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  23.85 
 
 		 228 aa  42  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  26.96 
 
 		 218 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  26.96 
 
 		 218 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 		 252 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  31.3 
 
 		 216 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 		 238 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>