132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0873 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  39.07 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.87 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  33.48 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.89 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.25 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.62 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  34.73 
 
 		 487 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  30.87 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  33.62 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.45 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.18 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  34.8 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  33.91 
 
 		 237 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  34.36 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.41 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.04 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.04 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.19 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.19 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  30.66 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.92 
 
 		 231 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.16 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.19 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  32.89 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  32.19 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  32.9 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  33.94 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  28.79 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.08 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.22 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  27.04 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  28.25 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.71 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  25.89 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  25.11 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  32.58 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.64 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  26.81 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  26.99 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.15 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.57 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0718  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.09 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000286264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.33 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  26.64 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  26.11 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.2 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.85 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  22.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  27.39 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  25.34 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  25.88 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  22.67 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  26.82 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  24.66 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2832  HAD superfamily hydrolase  24.53 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  24.89 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.83 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  23.68 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  29.41 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.58 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  24.76 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4573  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.84 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  26.57 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.43 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  25.43 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.08 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  26.73 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  22.91 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  24.32 
 
 		 222 aa  45.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 228 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  26.21 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  24.2 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  25.33 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  27.63 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.11 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.07 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>