150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1510 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
249 aa  488  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  56.62 
 
 
239 aa  218  6e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.67 
 
 
229 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.45 
 
 
233 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.46 
 
 
229 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  43.44 
 
 
246 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  43.98 
 
 
229 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
238 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  42.98 
 
 
272 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.81 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  40.43 
 
 
245 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.92 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  41.86 
 
 
237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.99 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.57 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  39.37 
 
 
232 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.28 
 
 
228 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.62 
 
 
233 aa  102  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  41.36 
 
 
231 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  34.5 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  33.92 
 
 
230 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.04 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.28 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.84 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.7 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.2 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  29.91 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  31.7 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  29.39 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.29 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.7 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  29.2 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.16 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  34.89 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  27.81 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.59 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  27.63 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.57 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.78 
 
 
218 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
222 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.67 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  29.02 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  32.62 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  25.46 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.44 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  25.71 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.06 
 
 
236 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.79 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.52 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.19 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  26.71 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  21.94 
 
 
210 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  24.3 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  29.66 
 
 
213 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.88 
 
 
222 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  33.08 
 
 
248 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  30.06 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
225 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  27.81 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.58 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  33.08 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  28.1 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  26.46 
 
 
228 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.47 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  33.59 
 
 
219 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.21 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  22.28 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  26.15 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  24.09 
 
 
217 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1573  hydrolase  27.46 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  25.34 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  24.24 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  25.9 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  27.73 
 
 
221 aa  45.4  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.62 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  59.57 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0174  HAD family hydrolase  26.85 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  21.7 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  25.81 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  25.18 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2152  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  21.29 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00286727  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.9 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.68 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  36.31 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  22.76 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  22.76 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.08 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>