88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3192 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  100 
 
 
272 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  44.24 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.27 
 
 
224 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  39.48 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.82 
 
 
229 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.98 
 
 
239 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.17 
 
 
249 aa  148  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  42.22 
 
 
233 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  40.65 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
238 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.67 
 
 
229 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  42.93 
 
 
249 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  35.94 
 
 
245 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  37.72 
 
 
234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  38.5 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.77 
 
 
228 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.55 
 
 
238 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.96 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  37.55 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.53 
 
 
233 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  32.87 
 
 
230 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.29 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.84 
 
 
246 aa  98.6  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.63 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.63 
 
 
231 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.23 
 
 
230 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.88 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.9 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.62 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  33.91 
 
 
234 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.55 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.3 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  24.79 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  29.66 
 
 
223 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  28.31 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  28.02 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.96 
 
 
215 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.68 
 
 
217 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  26.42 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  27.13 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  27.44 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  22.5 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
221 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
220 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  24.22 
 
 
232 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.96 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.25 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  35.8 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1883  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.31 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00501827  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.88 
 
 
233 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.68 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.44 
 
 
218 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  26.5 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  25.33 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  35.77 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  26.36 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
225 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  23.64 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  27.48 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.25 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03670  predicted phosphatase  34.06 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0282294  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  33.64 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.03 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  21.81 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 
217 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0288  HAD family hydrolase  26.25 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0966824  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0714  hydrolase  30.86 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  24.17 
 
 
211 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0569  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.58 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.895889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1515  hydrolase  25.86 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  25.23 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  23.96 
 
 
273 aa  42.7  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  26.41 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  25.11 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  29.36 
 
 
230 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1480  phosphonoacetaldehyde hydrolase  28.31 
 
 
264 aa  42  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>