137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4734 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4734  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
206 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  56 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.31 
 
 
218 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.06 
 
 
206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  52.24 
 
 
486 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  50.25 
 
 
213 aa  154  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8903  phosphatase-like protein  48.73 
 
 
205 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272506  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8096  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  53.73 
 
 
205 aa  147  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  47.03 
 
 
472 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6159  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  41.71 
 
 
202 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4626  hydrolase  35.08 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413109  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3579  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.8 
 
 
241 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0582871  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2442  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.98 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  29.47 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.65 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  23.72 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.39 
 
 
221 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.39 
 
 
221 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.89 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.53 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  24.53 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  24.53 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  24.53 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  24.06 
 
 
221 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.85 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0740  hypothetical protein  30.05 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  22.61 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  30.37 
 
 
224 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.88 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.7 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.27 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.17 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  32.37 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  29.38 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  31.88 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.92 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  25.82 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  37.93 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
238 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  25.7 
 
 
225 aa  52  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
223 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
232 aa  51.6  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 
216 aa  51.6  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  27.1 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.24 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33.86 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.51 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.02 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2887  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.24 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.64 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  49.15 
 
 
233 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  27.44 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.27 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.64 
 
 
213 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.71 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  29.9 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  27.89 
 
 
214 aa  48.9  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  28.57 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.090781  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.64 
 
 
213 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  27.49 
 
 
272 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  26.57 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  27.09 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  28.91 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  28.17 
 
 
224 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  25.39 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.32 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.86 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.16 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.22 
 
 
263 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  50 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  27.67 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 
232 aa  45.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.53 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  29.78 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.26 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
234 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  26.41 
 
 
245 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.07 
 
 
227 aa  45.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2086  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 
744 aa  45.1  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  22.4 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>