214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0147 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  100 
 
 		 486 aa  938    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  58.39 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  65.95 
 
 		 283 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4428  haloacid dehalogenase-like hydrolase  69.05 
 
 		 213 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.283335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  58.02 
 
 		 267 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  43.07 
 
 		 274 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  43.07 
 
 		 274 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  44.89 
 
 		 276 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  45.79 
 
 		 271 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  44.32 
 
 		 273 aa  213  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  43.64 
 
 		 272 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  45.19 
 
 		 275 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  42.34 
 
 		 281 aa  210  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  45.76 
 
 		 278 aa  206  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  49.29 
 
 		 284 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  44.12 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  44.69 
 
 		 296 aa  203  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  42.49 
 
 		 268 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  44.93 
 
 		 275 aa  202  8e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  39.93 
 
 		 269 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  41.85 
 
 		 269 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  39.49 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0817  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  58.21 
 
 		 206 aa  200  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  44.24 
 
 		 285 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  43.98 
 
 		 279 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  40.58 
 
 		 270 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  45.32 
 
 		 269 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  43.4 
 
 		 268 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  39.78 
 
 		 286 aa  195  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  39.26 
 
 		 267 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  37.36 
 
 		 278 aa  193  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  37.36 
 
 		 268 aa  192  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  43.4 
 
 		 268 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  43.85 
 
 		 275 aa  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  49.81 
 
 		 284 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  42.55 
 
 		 283 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  42.32 
 
 		 280 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  48.69 
 
 		 284 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  42.38 
 
 		 282 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  48.69 
 
 		 284 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  42.29 
 
 		 272 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  35.71 
 
 		 265 aa  179  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  40.07 
 
 		 296 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34060  predicted phosphatase  50 
 
 		 228 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  37.08 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  42.32 
 
 		 279 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  40.3 
 
 		 289 aa  169  9e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  40.38 
 
 		 313 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  40.44 
 
 		 294 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8903  phosphatase-like protein  54.17 
 
 		 205 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.272506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0479  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.8 
 
 		 218 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8096  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.82 
 
 		 205 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4734  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.24 
 
 		 206 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  40.77 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  40.38 
 
 		 273 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  38.93 
 
 		 276 aa  163  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  37.07 
 
 		 252 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  41.57 
 
 		 265 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  36 
 
 		 274 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  40.16 
 
 		 317 aa  160  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  40.74 
 
 		 265 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  44.07 
 
 		 283 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  35.79 
 
 		 288 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  34.91 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  36 
 
 		 274 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  36.63 
 
 		 267 aa  156  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  35.21 
 
 		 280 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  35.21 
 
 		 280 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  33.45 
 
 		 285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  35.34 
 
 		 268 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  40.52 
 
 		 275 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  33.58 
 
 		 271 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  38.66 
 
 		 274 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  35.56 
 
 		 278 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  34.47 
 
 		 275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  38.58 
 
 		 261 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  39.37 
 
 		 292 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  35.88 
 
 		 261 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  39.54 
 
 		 328 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  34.51 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  37.73 
 
 		 276 aa  141  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  36.3 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  33.72 
 
 		 268 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  30.51 
 
 		 270 aa  137  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6159  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  42.13 
 
 		 202 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  45.28 
 
 		 265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  36.87 
 
 		 257 aa  126  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  37.31 
 
 		 257 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  35.47 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  37.12 
 
 		 251 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  43.02 
 
 		 210 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  38.04 
 
 		 188 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4626  hydrolase  34.95 
 
 		 207 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413109  normal  0.0153666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  38.07 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  34.33 
 
 		 273 aa  99  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  37.5 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3579  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.34 
 
 		 241 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0582871  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  36.92 
 
 		 267 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  35.21 
 
 		 273 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2468  hypothetical protein  37.77 
 
 		 248 aa  88.6  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000271324  hitchhiker  0.000588391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>