123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_5288 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  35.29 
 
 		 269 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  41.05 
 
 		 275 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  34.04 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  38.95 
 
 		 292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  39.68 
 
 		 294 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  35.64 
 
 		 272 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  37.97 
 
 		 280 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  37.97 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  38.3 
 
 		 275 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  34.92 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  35.26 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  32.98 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  34.57 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  34.04 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  33.68 
 
 		 270 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  37.77 
 
 		 278 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  37.23 
 
 		 275 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  35.64 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  34.57 
 
 		 274 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  38.62 
 
 		 279 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  37.23 
 
 		 285 aa  104  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  33.51 
 
 		 274 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  36.17 
 
 		 328 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  36.32 
 
 		 283 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  34.24 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  31.91 
 
 		 274 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  35.45 
 
 		 289 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  35.11 
 
 		 273 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  34.57 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  34.04 
 
 		 268 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  38.59 
 
 		 486 aa  99.8  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  37.04 
 
 		 276 aa  98.6  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  36.36 
 
 		 288 aa  98.6  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  35.6 
 
 		 279 aa  98.2  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  35.64 
 
 		 313 aa  98.2  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  35.87 
 
 		 278 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  36.76 
 
 		 472 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.42 
 
 		 334 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  36.41 
 
 		 284 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  33.51 
 
 		 268 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  38.92 
 
 		 283 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  32.43 
 
 		 286 aa  94.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  33.51 
 
 		 317 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  34.24 
 
 		 275 aa  91.3  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  31.55 
 
 		 269 aa  91.3  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  34.76 
 
 		 272 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  33.51 
 
 		 280 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  32.8 
 
 		 274 aa  88.6  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  36.17 
 
 		 267 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  32.07 
 
 		 283 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  31.58 
 
 		 296 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  32.28 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  32.45 
 
 		 269 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  33.87 
 
 		 265 aa  84.3  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  29.26 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  31.02 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  32.62 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  29.79 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  31.63 
 
 		 275 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  34.24 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  33.51 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  34.78 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  35.11 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  27.66 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  31.02 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  34.41 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  29.38 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  30.53 
 
 		 276 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  27.66 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  32.98 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  33.7 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  29.95 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  31.22 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  31.52 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  26.98 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0092  hypothetical protein  35.05 
 
 		 310 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  29.53 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  30.32 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  33.51 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  31.75 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  31.58 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  28.57 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  29.57 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  33.54 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  33.16 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  30.41 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  31.31 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1465  hypothetical protein  32.94 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944037 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  28.42 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  25.26 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  29.38 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  28.4 
 
 		 518 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  28.4 
 
 		 518 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  28.78 
 
 		 534 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  27.38 
 
 		 526 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  27.66 
 
 		 518 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  27.13 
 
 		 521 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0766  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  23.47 
 
 		 367 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0406399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  29.41 
 
 		 519 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>