98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1465 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1465  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  545  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944037 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  55.63 
 
 
295 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0092  hypothetical protein  45.71 
 
 
310 aa  221  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  43.88 
 
 
273 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  43.84 
 
 
273 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2468  hypothetical protein  36.88 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000271324  hitchhiker  0.000588391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  37.7 
 
 
280 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  36.49 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  36.3 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  35.79 
 
 
268 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  39.38 
 
 
273 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  39.15 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  35.06 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  34.86 
 
 
276 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  37.85 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  36.68 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  36.32 
 
 
286 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  30.55 
 
 
270 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  33.94 
 
 
275 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  31 
 
 
274 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  31 
 
 
274 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  30.94 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  36.27 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  40.11 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  35.44 
 
 
268 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  36.95 
 
 
272 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  35.21 
 
 
276 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  32.51 
 
 
267 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  30.25 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  35.02 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  43.53 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  29.6 
 
 
281 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  36.95 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  35 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  33.72 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  40.09 
 
 
271 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  32 
 
 
275 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  35.2 
 
 
285 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  38.28 
 
 
278 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  36.84 
 
 
251 aa  109  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  36.13 
 
 
261 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  32.51 
 
 
278 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  28.52 
 
 
274 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  26.18 
 
 
285 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  31.9 
 
 
269 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  33.49 
 
 
282 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  31.63 
 
 
267 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  34.4 
 
 
317 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  34.69 
 
 
265 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  34.38 
 
 
265 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  35.02 
 
 
257 aa  105  6e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  33.8 
 
 
334 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  27.47 
 
 
274 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  33.95 
 
 
313 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  32.61 
 
 
276 aa  102  5e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  33.02 
 
 
289 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  35.02 
 
 
284 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  35.42 
 
 
279 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  29.17 
 
 
288 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  27.8 
 
 
268 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  27.01 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  27.01 
 
 
280 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  32.71 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  34.55 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  34.34 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  26.67 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  31.64 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  32 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  26.37 
 
 
252 aa  95.9  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  34.16 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  32.8 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  26.67 
 
 
268 aa  92.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  33.5 
 
 
265 aa  92  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  31.27 
 
 
296 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  32.69 
 
 
274 aa  89  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  35.83 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  32.49 
 
 
486 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  38.11 
 
 
284 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  86.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  38.15 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  27.44 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  28.64 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  30.99 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  29.03 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  36.89 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  36.04 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  28.43 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  26.76 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  32.84 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  35.08 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  28.49 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  33.98 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0553  hypothetical protein  28.14 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  26.37 
 
 
258 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  33.15 
 
 
188 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0352  PP-loop domain-containing protein  25.73 
 
 
258 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  34.83 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>