105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2185 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  604  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3010  hypothetical protein  46.07 
 
 
276 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.503965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  45.28 
 
 
275 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  45.42 
 
 
272 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  45.08 
 
 
275 aa  219  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  42.32 
 
 
274 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  42.32 
 
 
274 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2203  queuosine synthesis-like protein  43.96 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.12352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0151  PP-loop domain-containing protein  41.13 
 
 
270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1708  ExsB family protein  42.91 
 
 
278 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  42.05 
 
 
281 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  40.6 
 
 
269 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  38.2 
 
 
268 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2220  ExsB family protein  39.48 
 
 
286 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  39.1 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3906  PP-loop domain-containing protein  39.31 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000213353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  39.7 
 
 
274 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  41.29 
 
 
271 aa  199  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  41.44 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  38.2 
 
 
274 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1385  ExsB family protein  39.62 
 
 
267 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  40.54 
 
 
268 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0159  hypothetical protein  39.34 
 
 
283 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.018971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  40 
 
 
292 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  38.2 
 
 
274 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2271  hypothetical protein  42.54 
 
 
284 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  42.15 
 
 
313 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  42.91 
 
 
279 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1202  PP-loop domain protein  37.5 
 
 
276 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000899133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  41.83 
 
 
278 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  39.79 
 
 
317 aa  192  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  39.27 
 
 
252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1060  PP-loop domain-containing protein  39.54 
 
 
276 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  39 
 
 
268 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0392  hypothetical protein  41.44 
 
 
275 aa  186  5e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  41.22 
 
 
276 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0536  hypothetical protein  38.78 
 
 
269 aa  185  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.114391  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  37.74 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  40.65 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04890  conserved hypothetical protein TIGR00268  40.7 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.138392  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  40.08 
 
 
289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1049  hypothetical protein  39.02 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  36.54 
 
 
280 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  39.77 
 
 
288 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1637  PP family ATPase  36.09 
 
 
267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141063  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4189  Queuosine synthesis-like protein  38.49 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.653788 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  37.16 
 
 
265 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  40.91 
 
 
279 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  38.11 
 
 
272 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2325  hypothetical protein  43.33 
 
 
284 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2413  hypothetical protein  42.96 
 
 
284 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1542  hypothetical protein  42.22 
 
 
284 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3710  hypothetical protein  37.55 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.509319  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  38.49 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  38.49 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  38.01 
 
 
282 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2226  ExsB family protein  38.87 
 
 
265 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  34.62 
 
 
268 aa  168  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  39.44 
 
 
267 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  39.63 
 
 
283 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2118  ExsB family protein  36.29 
 
 
268 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  34.09 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1595  ExsB family protein  39.76 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  35.6 
 
 
271 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  34.73 
 
 
265 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  33.59 
 
 
261 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2431  hypothetical protein  38.17 
 
 
273 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0255  hypothetical protein  34.93 
 
 
275 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1841  hypothetical protein  41.53 
 
 
265 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31120  conserved hypothetical protein TIGR00268  40.16 
 
 
328 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1558  hypothetical protein  39.16 
 
 
283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  31.58 
 
 
278 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0147  ExsB family protein  39.93 
 
 
486 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1704  PP-loop domain protein  32.84 
 
 
285 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0697664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  38.1 
 
 
472 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1214  PP-loop domain-containing protein  34.98 
 
 
265 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4914  ExsB family protein  39.54 
 
 
267 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  35.1 
 
 
261 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  30.2 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  30 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  30.2 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0429  hypothetical protein  34.91 
 
 
295 aa  125  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1357  hypothetical protein  36.13 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.373596  hitchhiker  0.00844883 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3008  hypothetical protein  39.01 
 
 
273 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3800  PP family ATPase  41.85 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104125  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  30.97 
 
 
279 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_5288  predicted protein  39.15 
 
 
188 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0250872  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0092  hypothetical protein  29.97 
 
 
310 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1465  hypothetical protein  34.13 
 
 
284 aa  99  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.944037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0017  hypothetical protein  30.52 
 
 
273 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000871636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0368  hypothetical protein  31 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0352  PP-loop domain-containing protein  29.07 
 
 
258 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  32.83 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2468  hypothetical protein  31.28 
 
 
248 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000271324  hitchhiker  0.000588391 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1434  ExsB family protein  28.68 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.672941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  28.69 
 
 
258 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1058  ExsB family protein  31.38 
 
 
210 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0553  hypothetical protein  26.92 
 
 
257 aa  85.9  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.757724  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1669  ExsB family protein  29.05 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1742  ExsB family protein  28.38 
 
 
303 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>