57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1742 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1742  ExsB family protein  100 
 
 		 303 aa  619  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1669  ExsB family protein  98.35 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1605  ExsB family protein  55.03 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1080  ExsB family protein  53.42 
 
 		 358 aa  324  9e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.420451  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0537  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  52.19 
 
 		 322 aa  316  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.366098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  34.46 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  36.67 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  34.67 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1079  hypothetical protein  34.42 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2123  PP-loop domain-containing protein  34 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  30.87 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1003  hypothetical protein  28.29 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.309072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  32.9 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  29.45 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  29.25 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0361  PP-loop domain protein  31.79 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0101562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16911  PP family ATPase  29.61 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3314  hypothetical protein  31.97 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2511  hypothetical protein  29.14 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0316304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1629  PP-loop domain-containing protein  33.77 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1387  hypothetical protein  31.97 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000185278  normal  0.88629 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20171  PP family ATPase  31.08 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.700007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6080  ExsB family protein  27.45 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1143  hypothetical protein  31.08 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1583  ExsB family protein  30.87 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0923  ExsB family protein  31.58 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  28.48 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0342  PP-loop domain protein  29.8 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.09066e-30 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  28.03 
 
 		 276 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2185  hypothetical protein  28.38 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17781  PP family ATPase  26.71 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22871  ATP-utilizing enzymes of the PP-loop superfamily protein  28 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  45.8  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1608  PP-loop domain protein  30.87 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  25.64 
 
 		 599 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  43.55 
 
 		 583 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3933  hydrolase  29.05 
 
 		 472 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2938  ExsB family protein  39.34 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000232553  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1937  hypothetical protein  28.77 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4689  hypothetical protein  30.92 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.605066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.28 
 
 		 591 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1841  hypothetical protein  30.87 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226764  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1279  Queuosine synthesis-like protein  30.2 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1063  ExsB family protein  28.08 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0184  ExsB family protein  23.83 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1612  ExsB family protein  27.15 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.296662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1342  ExsB family protein  30.67 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  27.4 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1151  PP-loop domain-containing protein  27.63 
 
 		 271 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.293565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2987  hypothetical protein  31.33 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000894357  normal  0.775366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1000  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  29.03 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2054  asparagine synthase  29.22 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.264848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0485  ExsB family protein  25.16 
 
 		 258 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2865  ExsB family protein  29.25 
 
 		 278 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000508984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0340  ExsB family protein  25.83 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1596  hypothetical protein  31.17 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.659522  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  26.05 
 
 		 428 aa  42.4  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>