More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3297 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  60.87 
 
 		 577 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  60.41 
 
 		 586 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.93 
 
 		 597 aa  686    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  59.25 
 
 		 586 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  62.82 
 
 		 571 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  59.22 
 
 		 584 aa  676    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  60.34 
 
 		 577 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  61.76 
 
 		 590 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  62.5 
 
 		 591 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  60.17 
 
 		 591 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  60.27 
 
 		 598 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  100 
 
 		 599 aa  1194    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  60.03 
 
 		 611 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  57.9 
 
 		 601 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  57.24 
 
 		 553 aa  634  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  56.72 
 
 		 606 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  55.79 
 
 		 553 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  54.25 
 
 		 582 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  56.19 
 
 		 547 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  50.17 
 
 		 570 aa  558  1e-157  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  53.15 
 
 		 583 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  50.42 
 
 		 565 aa  535  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  47.35 
 
 		 566 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  43.57 
 
 		 583 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.42 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  46.08 
 
 		 566 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  47.5 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.91 
 
 		 543 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.76 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  41.18 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  39.36 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  43.83 
 
 		 576 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  43.65 
 
 		 576 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  45.87 
 
 		 587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  45.6 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  43.39 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  42.91 
 
 		 545 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  45.06 
 
 		 561 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  45.85 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  42.1 
 
 		 542 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  43.86 
 
 		 561 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  45.87 
 
 		 567 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  45.7 
 
 		 554 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  45.42 
 
 		 537 aa  435  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  43.93 
 
 		 545 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  44.33 
 
 		 540 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  42.61 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  44.43 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  41.92 
 
 		 542 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  43.2 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  45.85 
 
 		 554 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  42.53 
 
 		 540 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  41.71 
 
 		 539 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  43.52 
 
 		 538 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  42.39 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  46.15 
 
 		 559 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  42.21 
 
 		 567 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  38.24 
 
 		 575 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  41.88 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.43 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  42.49 
 
 		 562 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  46.02 
 
 		 550 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  43.66 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  46.1 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  43.84 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  41.84 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  41.84 
 
 		 540 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  45.3 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  45.53 
 
 		 571 aa  425  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  44.09 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  45.6 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  41.67 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  43.37 
 
 		 565 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  43.19 
 
 		 573 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  43.08 
 
 		 546 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  45.9 
 
 		 564 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  45.04 
 
 		 587 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  42.98 
 
 		 566 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  43.24 
 
 		 560 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.5 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  39.29 
 
 		 540 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  45.3 
 
 		 585 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.54 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  44.12 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  38.18 
 
 		 543 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  45.78 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  45.78 
 
 		 549 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  43.77 
 
 		 545 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  43.32 
 
 		 559 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  44.52 
 
 		 585 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0125  NAD synthetase  44.65 
 
 		 576 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  40.68 
 
 		 560 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  41.78 
 
 		 566 aa  412  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.54 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1986  NAD synthetase  46.03 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  39.93 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  42.49 
 
 		 552 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  45.25 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  40.99 
 
 		 562 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  44.16 
 
 		 566 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>