49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1605 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1605  ExsB family protein  100 
 
 
342 aa  683    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1080  ExsB family protein  57.77 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.420451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1742  ExsB family protein  55.03 
 
 
303 aa  332  4e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1669  ExsB family protein  54.7 
 
 
303 aa  328  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0537  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  46.54 
 
 
322 aa  276  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.366098  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1781  ExsB family protein  27.8 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1824  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 
268 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  26.78 
 
 
268 aa  59.7  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2185  hypothetical protein  27.78 
 
 
270 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999968  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11710  NAD+ synthetase  26.74 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.996966  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1769  PP-loop domain protein  31.21 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.325381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1028  tRNA(5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)- methyl transferase  26.28 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1431  hypothetical protein  28.32 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2828  NAD+ synthetase  28.21 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1718  hypothetical protein  30.43 
 
 
257 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  35.44 
 
 
552 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  27.22 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  25.76 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  34.15 
 
 
576 aa  47  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  34.15 
 
 
576 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17581  PP family ATPase  31.33 
 
 
252 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.414298  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0693  PP-loop domain-containing protein  27.11 
 
 
282 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.443839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  39.71 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  23.63 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  51.16 
 
 
332 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0722  hypothetical protein  27.33 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1663  hypothetical protein  27.5 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  37.29 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1442  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  28.97 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00222564  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2603  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  25 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.153014  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  30.43 
 
 
556 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  26.61 
 
 
526 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  27.53 
 
 
244 aa  43.5  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.82 
 
 
885 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0650  GMP synthase  37.21 
 
 
526 aa  43.1  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17621  PP family ATPase  29.38 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1460  NAD+ synthetase  40.91 
 
 
635 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  27.78 
 
 
267 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0226  GMP synthase subunit B  47.92 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.612389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  48.72 
 
 
238 aa  43.1  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0822  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  30.49 
 
 
505 aa  43.1  0.007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  31.25 
 
 
583 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0261  NAD+ synthase  28.72 
 
 
505 aa  43.1  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0371022  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1016  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  29.91 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  38.3 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  32.58 
 
 
334 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0177  tRNA methyl transferase-like protein  22.58 
 
 
313 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  26.27 
 
 
567 aa  42.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  35.8 
 
 
525 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>