More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2382 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  100 
 
 
334 aa  690    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  59.62 
 
 
323 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  59.31 
 
 
323 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  58.99 
 
 
323 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  58.13 
 
 
328 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  56.69 
 
 
324 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  57.79 
 
 
332 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  57.73 
 
 
335 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  57.1 
 
 
328 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  57.1 
 
 
330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  53.48 
 
 
328 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  49.51 
 
 
345 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  48.8 
 
 
342 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  51.56 
 
 
325 aa  288  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  33.33 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  38.95 
 
 
281 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  39.76 
 
 
281 aa  169  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  35.47 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.81 
 
 
258 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  32.59 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  31.46 
 
 
279 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  30.43 
 
 
258 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  30.07 
 
 
258 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  29.37 
 
 
258 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  28.32 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  32.81 
 
 
332 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  30 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  29.47 
 
 
264 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  30.45 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  28.32 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  32.03 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  29.18 
 
 
275 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  30.6 
 
 
302 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  28.94 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  28.76 
 
 
285 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  30.86 
 
 
277 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.27 
 
 
247 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  28.52 
 
 
271 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  29.28 
 
 
273 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  29.43 
 
 
264 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  28.81 
 
 
277 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  31.82 
 
 
246 aa  103  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  30.61 
 
 
238 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  30.47 
 
 
269 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  31.93 
 
 
241 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  29.23 
 
 
273 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  29.55 
 
 
243 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  33.59 
 
 
276 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  28.12 
 
 
283 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  25.28 
 
 
237 aa  95.9  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0248  NAD synthetase  29.55 
 
 
270 aa  95.9  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  32.27 
 
 
251 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  26.51 
 
 
273 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  27.18 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  29.75 
 
 
277 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  29.3 
 
 
276 aa  92.8  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  30.74 
 
 
248 aa  93.2  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0310  NAD synthetase  29.77 
 
 
267 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.737359  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  27.34 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  29.96 
 
 
246 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  30.64 
 
 
246 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  25.91 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  28.4 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  26.14 
 
 
273 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  28.38 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  28.91 
 
 
277 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  28.83 
 
 
326 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  31.45 
 
 
279 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  28.38 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  31.62 
 
 
255 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0918  NAD+ synthetase  28.69 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.942289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  27.04 
 
 
261 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  25.4 
 
 
241 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  26.36 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  27.13 
 
 
250 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  27.61 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  27.91 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0652  NAD+ synthetase  23.86 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  26.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  30.45 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  26.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  28.16 
 
 
571 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  25.87 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  27.72 
 
 
585 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01960  NAD synthetase  31.62 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  29.6 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  27.33 
 
 
543 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  28.32 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  27.54 
 
 
587 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  26.37 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  41.32 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  23.4 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  27.11 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  25.29 
 
 
554 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.91 
 
 
552 aa  76.3  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1792  NAD+ synthetase  27.82 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11710  NAD+ synthetase  27.57 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.996966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0957  NAD synthetase  29.77 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  26.79 
 
 
585 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06585  NH(3)-dependent NAD synthetase  26.89 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.878387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>