More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0878 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0878  NAD+ synthetase  100 
 
 
294 aa  595  1e-169  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0283  NAD+ synthetase  59.16 
 
 
281 aa  316  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000382877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0284  NAD+ synthetase  58.78 
 
 
281 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0086  NAD+ synthetase  55.23 
 
 
279 aa  295  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.485052  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  34.34 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  36.98 
 
 
258 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  35.23 
 
 
258 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  36.06 
 
 
263 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2868  NAD synthetase  35.23 
 
 
332 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  35.25 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2382  NAD synthetase  35.47 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.846278  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  34.47 
 
 
258 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  34.09 
 
 
258 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2881  NAD synthetase  31.84 
 
 
330 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  33.33 
 
 
251 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2788  NAD synthetase  32.22 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2957  NAD synthetase  33.46 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  37.2 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2865  NAD synthetase  33.46 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3650  NAD synthetase  34.46 
 
 
345 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0269  NAD synthetase  31.7 
 
 
330 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  34.19 
 
 
276 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1248  NAD synthetase  31.8 
 
 
324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  34.01 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  36.4 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4337  NAD synthetase  32.84 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0886031  normal  0.014304 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  36.32 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0488  NAD synthetase  32.85 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4477  NAD synthetase  32.96 
 
 
328 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  32.77 
 
 
277 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  34.33 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  32.23 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3178  NAD synthetase  33.08 
 
 
328 aa  130  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  34.45 
 
 
277 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  34.73 
 
 
622 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1083  NAD synthetase  33.46 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.402992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  32.26 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  34.56 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  33.05 
 
 
283 aa  126  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  33.9 
 
 
277 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  32.34 
 
 
273 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  33.33 
 
 
241 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  38.39 
 
 
250 aa  123  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  33.2 
 
 
264 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.45 
 
 
247 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  31.91 
 
 
273 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1635  NAD+ synthetase  32.53 
 
 
243 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.35662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  31.27 
 
 
246 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  31.49 
 
 
273 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  31.27 
 
 
246 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  31.8 
 
 
261 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  32.94 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  31.39 
 
 
264 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  31.06 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  28.57 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  31.27 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  31.91 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  33.76 
 
 
247 aa  116  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2601  NAD+ synthetase  31.22 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2475  NAD+ synthetase  28.05 
 
 
284 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  30.98 
 
 
238 aa  116  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0922  NAD+ synthetase  31.72 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2324  NAD+ synthetase  30.89 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  28.52 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2324  NAD+ synthetase  31.01 
 
 
326 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297983  hitchhiker  0.00625352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1801  NAD+ synthetase  33.05 
 
 
250 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431835 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  30.36 
 
 
283 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  33.62 
 
 
289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1437  NAD+ synthetase  33.6 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.541928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1366  NAD+ synthetase  31.15 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  32.07 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  32.02 
 
 
543 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  34.31 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0526  NAD+ synthetase  34.31 
 
 
263 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.313435  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2526  NAD+ synthetase  32.78 
 
 
246 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1544  NAD+ synthetase  29.46 
 
 
332 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1044  NAD+ synthetase  35.68 
 
 
268 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0798  NAD+ synthetase  32.16 
 
 
255 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0966  NAD+ synthetase  31.09 
 
 
237 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0240319 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  29.46 
 
 
248 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  30.07 
 
 
546 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0793  NAD synthetase  34.03 
 
 
276 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  27.54 
 
 
277 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  28.69 
 
 
277 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  29.63 
 
 
526 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl521  NH3-dependent NAD+ synthetase  32.43 
 
 
244 aa  102  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2294  NAD synthetase  29.97 
 
 
276 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206886  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0926  NAD+ synthetase  33.04 
 
 
248 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.486288  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2901  NAD+ synthetase  44.6 
 
 
304 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  27.83 
 
 
566 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0531  NH3-dependent NAD+ synthetase  32.3 
 
 
253 aa  100  3e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.000693005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5317  NAD+ synthetase  31.71 
 
 
325 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288579  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1302  NAD synthetase  33.88 
 
 
269 aa  100  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.120392  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03120  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.04 
 
 
280 aa  99.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2021  NAD synthetase  30.11 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2658  NAD synthetase  30.23 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1803  NAD synthetase  30.23 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00266158  hitchhiker  0.0000311933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2543  NAD synthetase  30.23 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.680387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2438  NAD synthetase  28.83 
 
 
296 aa  99  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147914  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  30.43 
 
 
566 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>