More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1813 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1813  NAD synthetase  100 
 
 
277 aa  566  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.501702  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0701  NAD synthetase  78.07 
 
 
278 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000652237  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0810  NAD synthetase  74.37 
 
 
277 aa  434  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00066605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0857  NAD synthetase  74.01 
 
 
277 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1279  NAD synthetase  71.17 
 
 
276 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0524  NAD synthetase  71.64 
 
 
283 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00084684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0564  NAD synthetase  71.12 
 
 
277 aa  401  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.514395  normal  0.335445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3421  NAD synthetase  57.25 
 
 
273 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3482  NAD synthetase  56.88 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000292303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3754  NAD synthetase  57.84 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.583588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2228  NAD synthetase  56.34 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.529939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0652  NAD synthetase  56.72 
 
 
273 aa  308  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2862  NAD synthetase  54.51 
 
 
271 aa  298  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158436  hitchhiker  0.000000740071 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2118  NAD+ synthetase  55.68 
 
 
283 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0247  NAD+ synthetase  46.69 
 
 
261 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1348  NAD+ synthetase  43.65 
 
 
267 aa  238  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0851  NAD(+) synthase  46.18 
 
 
257 aa  222  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0275  NAD+ synthetase  44.32 
 
 
289 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0125  NAD+ synthetase  43.65 
 
 
250 aa  206  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0831  NAD synthetase  40.64 
 
 
246 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0228382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0901  NAD synthetase  40.64 
 
 
246 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1108  NAD+ synthetase  38.66 
 
 
285 aa  192  3e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.888538  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  40.84 
 
 
622 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1200  NAD synthetase  40.24 
 
 
246 aa  191  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1025  NAD+ synthetase  38.96 
 
 
247 aa  188  8e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2320  NAD synthetase  40.08 
 
 
265 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  40.82 
 
 
546 aa  185  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0900  NAD synthetase  38.8 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.953423  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1078  NAD+ synthetase  39.84 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1173  NAD+ synthetase  40.61 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0090  NAD synthetase  37.08 
 
 
277 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.670089  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  42.11 
 
 
543 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1444  NAD+ synthetase  39.85 
 
 
279 aa  169  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1020  NAD+ synthetase  39.61 
 
 
281 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.602431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1809  NAD synthetase  38.62 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  39.19 
 
 
591 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0992  NAD+ synthetase  35.48 
 
 
246 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  41.01 
 
 
584 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  37.88 
 
 
546 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1352  NAD synthetase  35.86 
 
 
275 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2846  NAD+ synthetase  36.67 
 
 
264 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0476  NAD+ synthetase  37.24 
 
 
264 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  38.81 
 
 
561 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.15 
 
 
591 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0660  NAD+ synthetase  41.2 
 
 
258 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  40 
 
 
540 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  33.8 
 
 
552 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  37.02 
 
 
545 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1197  NAD+ synthetase  41.59 
 
 
238 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1353  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.27 
 
 
251 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000287377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  36.5 
 
 
560 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  39.56 
 
 
571 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.77 
 
 
543 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0662  NAD+ synthetase  36.84 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0164353  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  35.64 
 
 
572 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  36.92 
 
 
546 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0594  NAD+ synthetase  38.43 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0895907  normal  0.216266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  35.64 
 
 
568 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  38.52 
 
 
554 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1800  NAD synthetase  35.64 
 
 
572 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2412  NAD synthetase  35.64 
 
 
572 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  36.64 
 
 
545 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  39.18 
 
 
566 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.64 
 
 
577 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  35.21 
 
 
564 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  36.15 
 
 
554 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  39.11 
 
 
567 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  36.6 
 
 
576 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0229  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.43 
 
 
258 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  36.23 
 
 
566 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0182  NAD+ synthetase  35.36 
 
 
526 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  36.36 
 
 
576 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  36.23 
 
 
566 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  36.23 
 
 
566 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  36.23 
 
 
566 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  36.23 
 
 
566 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  36.23 
 
 
609 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  36.23 
 
 
609 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  35.85 
 
 
561 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3513  NAD+ synthetase  35.04 
 
 
302 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1324  NAD+ synthetase  37.6 
 
 
258 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.873585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1161  NAD synthetase  35.39 
 
 
277 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.648539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0853  NAD synthetase  35.66 
 
 
556 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1454  NAD+ synthetase  37.98 
 
 
263 aa  149  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.770644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  35.27 
 
 
566 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  37.73 
 
 
598 aa  149  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.43 
 
 
597 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  35.77 
 
 
567 aa  148  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  34.81 
 
 
536 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  36.23 
 
 
576 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0716  NAD synthetase  38.04 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19800  NAD+ synthetase  37.6 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.497011  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  36.36 
 
 
599 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0753  NAD synthetase  36.4 
 
 
557 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.860251  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  36.03 
 
 
565 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  36.36 
 
 
553 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1657  NAD+ synthetase  34.27 
 
 
241 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  36.06 
 
 
576 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19030  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.67 
 
 
247 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  35.27 
 
 
562 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>