More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0217 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  56.76 
 
 
546 aa  660    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  100 
 
 
554 aa  1142    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  46.95 
 
 
543 aa  485  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  46.86 
 
 
540 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  48.04 
 
 
571 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3756  NAD+ synthetase  42.93 
 
 
573 aa  466  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  44.7 
 
 
561 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  44.38 
 
 
567 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  44.7 
 
 
561 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.5 
 
 
556 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  43.39 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  42.7 
 
 
552 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  45.8 
 
 
543 aa  455  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  43.89 
 
 
561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  43.13 
 
 
560 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  43.89 
 
 
561 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  43.1 
 
 
584 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  44.17 
 
 
577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  43.73 
 
 
557 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  44.03 
 
 
558 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  42.75 
 
 
550 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  42.55 
 
 
567 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  44.52 
 
 
556 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  41.3 
 
 
540 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  41.72 
 
 
576 aa  433  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  41.84 
 
 
548 aa  435  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  41.3 
 
 
540 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  44.02 
 
 
540 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  41.55 
 
 
576 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  41.12 
 
 
540 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  43.26 
 
 
558 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.55 
 
 
561 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  40.34 
 
 
574 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  41.77 
 
 
574 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  41.73 
 
 
538 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  40.67 
 
 
558 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  40.22 
 
 
540 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  40.14 
 
 
575 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  41.59 
 
 
556 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  40.31 
 
 
566 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  40.84 
 
 
566 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  41.11 
 
 
554 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  40.91 
 
 
567 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  40.91 
 
 
567 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.58 
 
 
577 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.98 
 
 
566 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  41.98 
 
 
559 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  41.12 
 
 
542 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  41.53 
 
 
539 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  41.7 
 
 
545 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.62 
 
 
535 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  40.57 
 
 
554 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  39.1 
 
 
542 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  40.36 
 
 
546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  39.25 
 
 
583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  39.18 
 
 
587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.31 
 
 
569 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  38.55 
 
 
573 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  38.92 
 
 
542 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  41.27 
 
 
569 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  40.51 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  40.51 
 
 
536 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  40.96 
 
 
561 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  40.95 
 
 
566 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  38.57 
 
 
552 aa  396  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  40.96 
 
 
569 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  40.54 
 
 
541 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  38.8 
 
 
577 aa  395  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  39.09 
 
 
569 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.59 
 
 
537 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  40.97 
 
 
549 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  39.29 
 
 
552 aa  395  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  40.97 
 
 
549 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  40.85 
 
 
550 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  39.29 
 
 
564 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  39.69 
 
 
564 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  39.89 
 
 
554 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  38.39 
 
 
569 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  39.51 
 
 
566 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  37.59 
 
 
545 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  40.79 
 
 
539 aa  382  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  39.39 
 
 
538 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  37.78 
 
 
576 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  39.48 
 
 
561 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  40.18 
 
 
539 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2238  NAD+ synthetase  39.53 
 
 
538 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.695951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  40.41 
 
 
566 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  39.54 
 
 
554 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  39.64 
 
 
545 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  40.24 
 
 
566 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  40.24 
 
 
609 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  40.24 
 
 
566 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  40.24 
 
 
566 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  40.62 
 
 
564 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  39.46 
 
 
545 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  38.94 
 
 
559 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  38.82 
 
 
547 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  40.24 
 
 
566 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  39.61 
 
 
560 aa  375  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  40.24 
 
 
609 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>